כמו בכל העולם, גם בשטח הפלסטיני הכבוש הייתה מגפת COVID-19 גורם החשש העיקרי בתקופה הנסקרת. ב־5 במרס 2020 הכריז ראש הממשלה הפלסטיני על מצב חירום, לאחר שבעיר בית לחם אומתו הנדבקים הראשונים. האמצעים שננקטו כללו הקפאה של רוב הפעילות המסחרית ושל כל הפעילות החינוכית, איסור על התכנסויות בציבור והגבלות נוקשות על תנועה ממקום למקום. מצב החירום הוארך בבוא העת עד לתחילת יוני, אבל הסתיים למעשה מאז שלהי מאי, עם פתיחתם מחדש של בנקים, משרדי ממשלה, חנויות ומערכות התחבורה הציבורית. ברצועת עזה מעבר ארז שבשליטת ישראל ומעבר רפיח שבשליטת מצרים היו סגורים רוב הזמן מאז אמצע מרס, ונוסעים שנכנסו דרכם לעזה נשלחו למתקני בידוד לשהות של 14 יום, שבהמשך הוארכה ל־21 יום. בסך הכול, באמות מידה עולמיות, תפוצת המגפה ברחבי השטח הפלסטיני הכבוש הייתה נמוכה, ורק חמישה בני אדם מתו ממנה. נכון לתחילת יוני אומתו בסך הכול 630 נדבקים פלסטינים, 179 מהם בירושלים המזרחית, 390 ביתר הגדה המערבית ו־61 ברצועת עזה.